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バイオインフォマティクスデータ解析
研究支援・試験受託サービスにバイオインフォマティシャンによる次世代シーケンスデータ解析を加え、in vitro試験からデータ解析までトータルで貴社の研究をサポートします。
iPSポータルに依頼するメリット
通常の委託先の場合、データの分析結果だけが納品され、結局のところデータ分析に詳しい人にしか理解できないケースが多々あります。iPSポータルは細胞実験から受託していますので、弊社と業務提携したバイオインフォマティシャンと連携して細胞実験からデータ分析までをトータルで評価します。また、データ分析の解釈については、バイオインフォマティシャンによる解説とディスカッションの機会もアレンジします。そして、次の試験の方向性についても、バイオインフォマティシャンと共に検討し、専門家の立場としてご提案します。
- 解析メニュー
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- RNA seq
- small RNA-seq
- エピジェネティクス
- ヒストン ChIP-seq
- DNAメチル化
- エクソーム解析
- スプライシング
- Protein analysis
- 転写因子
- SNP
遺伝子発見解析
（クラスタリング解析）
SNP解析
バイオインフォマティクスデータ解析を利用した研究支援の例
- Step.1試験デザインご提案
- バイオインフォマティシャンとディスカッションしながら、RNAseqなどの網羅的解析を用いた試験デザインの作成をお手伝いします。
- Step.2In vitro試験
- iPS細胞や分化細胞などに対する被験物質の影響を評価します。
- Step.3発現解析
- 次世代シーケンスによる解析により、遺伝子発現などの網羅的解析を行います。
- Step.4バイオインフォマティクス解析
- クラスター分析や主成分分析により関連分野を抽出
- Step.5結果報告
- バイオインフォマティシャンとのディスカッションやKOLとのヒアリングを設定するなど、次試験のご提案を行います。
- 実施例
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・IGVなどのソフトウェアによるマッピング結果の描画
・遺伝子発現解析（MA plot）
・遺伝子発現解析（クラスタリング解析）
・ES細胞のNaïve 化過程のPCA解析
・ChIP-seq 解析
・SNP解析
- 結果一例
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健常者由来iPS細胞と疾患患者由来iPS細胞から分化誘導させた時の遺伝子発現解析の例
遺伝子Aと遺伝子Bについて変化が認められた。
次の試験のご提案
・遺伝子A、Bに対する阻害剤や被験物質の効果
・異なる細胞種における遺伝子A、Bの発現変化疾患の発症機序解析
新規治療薬の探索